海关六套帐的问题，是解决企业报关、财务、仓库三帐统一的关键问题，也是规范管理企业进出口报关的重要环节.成功解决深圳六套帐的问题，也就是解决报关、财务、仓库的不统一问题的关键。 
      深圳六套帐看似简单，但做起来涉及的内容很多，工作量相对较大，特别是如何实施的问题。因为六套帐实施的是整个企业的所有物料管理，从物料的分类、编号、对应备案号归并、单重换算等数据分类，再是全部数据的录入电脑，如果使用MRP/ERP系统管理，还要从生产管理系统中倒入数据并整理，同时进行仓库盘点，盘点选择在不影响正常生产的时间内进行，另外就是电脑的配置，相关各部门的使用操作培训及协同工作的配合等等。 
      2002年海关出台了《深圳海关关于对企业帐簿、单证设置的管理规定》，对企业的帐册明确了相关的规定，但是由于海关备案与企业生产管理上有着许多差异，受专业知识，做帐经验的限制，现时大多数企业的海关帐本不符合海关要求，经不起海关查帐。 
      因此，无论从海关规定要求，还是企业自身管理，从现在做起，规范管理、规范做帐是非常必要的，越迟难度及工作量越大。

      深关调（ 2002 ） 190 号文下达三年多来，在深圳海关注册登记、备案的企业都比较重视，大部分企业都已建立了海关六套帐。由于企业对海关相关法规不甚理解，对海关六套帐性质及内涵不甚理解，没有编好企业海关合同备案进口料件与出口产品粗分类与企业仓库实际库存进口料件与出口产品明细分类的对照表，没有编好企业进口料件与出口产品在海关合同备案的数量、重量单位与企业仓库实际发生的数量、重量单位的换算表，以及企业存货管理的不规范，外资企业海关六套帐目前尚存在不少问题。如果海关机关到企业进行检查，不少企业将很难过关。如何做好海关六套帐，根据海关相关法规的规定，针对当前企业海关六套帐普遍存在的一些共性问题，提出如下一些看法，供各企业参考。 一、正确认识海关六套帐的内涵和性质 
     海关六套帐是指： 1 、进口原料进出仓帐，反映企业直接进口材料和转厂购入料件的进仓、出仓和结余情况； 2 、国内购料进出仓帐，反映国内购入材料的进仓、出仓和结余情况； 3 、成品进出仓帐，反映出口产品和转厂销售产品的进仓、出仓和结余情况； 4 、成品（国内销售）进出仓帐，反映内销产品进仓、出仓和结余情况； 5 、委托加工、发外加工帐，反映委托和发外加工材料的进仓、出仓和结余情况； 6 、边角（废料）残次品帐，反映边角料、废料、残次品和废品的进仓、出仓和结余情况。 
     对海关六套帐的帐簿性质，目前社会上尚有一些模糊的认识。主要表现在：一是把海关六套帐认为是海关帐，由报关员去做。这是对海关帐的误解，海关六套帐不是海关帐，海关帐实质上是海关合同备案帐，由报关员根据海关合同备案的出口产品，构成出口产品的料件构成、形成产品各种原材料的单位消耗定额和进口料件材料自然损耗率，对其海关合同备案料件的计划统计帐簿，此帐由报关员做；二是把海关六套帐认为是会计存货明细帐，是对企业的原材料、辅助材料、包装物、低值易耗品、在产品、半成品、外购商品等存货，着重从金额上进行核算从而确定库存存货成本和发出存货成本的帐簿。海关六套帐既不是报关员做的海关合同备案帐，也不是会计人员做的存货明细帐，海关六套帐的实质是按照海关法规的规定和海关管理的需要而设置的企业仓库存货实物帐，因为深圳海关（ 2002 ） 190 号文规定要设六套仓库存货实物帐，因而简称海关六套帐。深圳海关注册登记和备案的企业，基本都已按照会计制度的规定建立了一套仓库存货实物帐，企业没有必要再去另外建立一套海关仓库存货实物帐。企业可根据《深圳海关关于对企业帐簿、单证设置的管理规定》的具体要求，从企业的实际出发，将原来进销存的仓库存货实物帐，对其内容和格式进行适当的改制，从而转换成海关六套仓库存货实物帐。海关六套仓库存货实物帐，应由仓库人员去做，因与会计的存货明细帐和海关合同备案帐有着密切的关系，需由会计人员和报关人员的帮助和配合。目前有的外资企业为了应付海关检查，仓库人员继续去做仓库存货实物帐，又要报关人员或会计人员再做海关六套帐仓库存货实物帐。重复做帐，浪费了人力物力，而且更重要的是仓库人员做的仓库存货实物帐与报关人员或会计人员做的海关仓库存货实物帐又不一样，今后海关和税务检查，将被认定为是假帐而受到处罚。